熒光顯微鏡的濾光裝置，是按著用途來作以下分類的：
1、激發濾光片是按著激發濾光片加在汞燈與二向色鏡兩者間的，物鏡之前的，此濾光片的作用在消除無用光譜成分，或許激發光波中有著成分通過的作用達到被檢標本上。
2.阻斷濾光征在于物鏡之上，二向色鏡與目鏡間的，用以阻斷或者吸收光路中的激發光與一些波長較短的光線，以防傷害眼睛作一個熒光透過作用，用來作斷開與吸收作用的。通過樣品作出熒光作用。
3.分色鏡，是通熒光顯微鏡中除上述兩類濾色鏡外，尚有一個很重要的角色鏡來作一個二向色鏡，其位于汞燈激發濾光片所構成的平行光軸與目鏡與物鏡所構成的一個直光軸的所相交處，是可以斜向安 裝于光路之中，由鍍膜的光學玻璃所制成的，鏡面方位與上述兩光軸交角均呈四十五度角，兼有透射長波光線與反射短波光線的功能，在熒光顯微鏡所承當色光的分流作用的。
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